Emilia Larsson har kvartersklubben IK Östria Lambohov som moderklubb, men fick det mesta av sin fotbollsfostran i Linköpings FC. Där debuterade hon i A-laget redan som 15-åring, i Svenska Cupen. 2014 och 2015 gnuggade hon sig närmre att färga på seniornivå, med ett inhopp i Damallsvenskan vartdera året, och nästa säsong blev chanserna i stjärnspäckade LFC fler. Den 2 september 2016 gjorde då 18-åriga Larsson sitt första allsvenska mål, mot Kvarnsveden, och sammantaget luftades hon detta år från bänken vid nio tillfällen.